Особенностью данного набора является использование молекулярных баркодов, которые, вместе с классической методикой маркировки дубликатов, позволяют значительно улучшить возможности детектирования низкокопийных соматичеких вариантов, что найдет свое применение в исследованиях, связанных с раковыми заболеваниями.

При помощи данного набора можно приготовить библиотеки как из высококачественной ДНК из различных тканей, так и из низкокачественной ДНК, выделенной из образов, фиксированных в формалине (FFPE). Классический протокол был значительно оптимизирован, и теперь гибридизация с целевыми зондами длится всего 90 минут, а для приготовления библиотеки требуется 10 нг ДНК.

Таким образом, набор для целевого обогащения SureSelectXT HS совмещает в себе преимущества классического метода маркировки дубликатов с методом детектирования дубликатов при помощи молекулярных баркодов, а оптимизированный для FFPE протокол делает набор SureSelectXT HS одним из самых продвинутых инструментов изучения соматических вариантов.

Оптимизированный для FFPE протокол

Возможность приготовления библиотеки как из высококачественной ДНК из различных тканей, так и из низкокачественной ДНК, выделенной из образов, фиксированных в формалине (FFPE).

Для приготовления библиотеки требуется 10 нг ДНК

Высокая чувствительность

Исключение амплификации и секвенирования артефактов, которые ограничивают чувствительность NGS
Использование молекулярных баркодов, что позволяет значительно улучшить возможности детектирования низкокопийных соматичеких вариантов
Повышенная чувствительность обнаружения низкочастотных аллелей, до 1% или менее

Оптимизированный рабочий процесс

Сокращенное количество этапов подготовки библиотеки, предотвращающее потерю ДНК
Процесс подготовки образцов стал быстрее и эффективнее с заранее подготовленными растворами реагентов master-mixed - гибридизация с целевыми зондами длится всего 90 минут
Преобразование образцов в готовые к секвенированию библиотеки за 8 часов